Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PERM1Q5SV97 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms