Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT1Q5JUK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms