Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf38Q5JPI3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms