Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGO2Q562F6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms