Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms