Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYTL3Q4VX76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL3Q4VX76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms