Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTXN3Q4LDR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTXN3Q4LDR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms