Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACKR1Q16570 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACKR1Q16570 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACKR1Q16570 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms