Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL23Q16540 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL23Q16540 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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