Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP3Q15836 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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