Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms