Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A5Q15758 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A5Q15758 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A5Q15758 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms