Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SURF2Q15527 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SURF2Q15527 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms