Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP1Q15276 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RABEP1Q15276 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP1Q15276 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP1Q15276 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP1Q15276 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP1Q15276 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RABEP1Q15276 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms