Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK3Q15120 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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