Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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