Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA9Q13797 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA9Q13797 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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