Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNASE1L3Q13609 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE1L3Q13609 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNASE1L3Q13609 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNASE1L3Q13609 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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