Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRR1Q13601 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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