Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf57Q0VDD7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf57Q0VDD7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf57Q0VDD7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms