Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
GOLGA3Q08378 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
GOLGA3Q08378 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GOLGA3Q08378 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GOLGA3Q08378 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms