Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms