Protein–RNA interactions for Protein: Q04756

HGFAC, Hepatocyte growth factor activator, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGFACQ04756 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HGFACQ04756 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HGFACQ04756 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HGFACQ04756 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HGFACQ04756 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms