Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 CLP1YOR250C 1338 nt5.67□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 NOP7YGR103W 1818 nt5.67□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YDR541CYDR541C 1035 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 JJJ3YJR097W 519 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YLL059CYLL059C 507 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YPL014WYPL014W 1146 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 VPS28YPL065W 729 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 MCM6YGL201C 3054 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 VTH1YIL173W 4650 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 VTH2YJL222W 4650 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 RFA1YAR007C 1866 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 VPS70YJR126C 2436 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 GEP3YOR205C 1671 nt5.66□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 RIM101YHL027W 1878 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YGR176WYGR176W 348 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YHL045WYHL045W 348 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 ARP1YHR129C 1155 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YIL086CYIL086C 309 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 RHO3YIL118W 696 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YKL223WYKL223W 333 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.65□□□□□ -1.5
UFO1Q04511 VBA1YMR088C 1689 nt5.65□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 AIM17YHL021C 1398 nt5.65□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 ACC1YNR016C 6702 nt5.65□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 VPS1YKR001C 2115 nt5.65□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 HRP1YOL123W 1605 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YHR045WYHR045W 1683 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 VCX1YDL128W 1236 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 AI3Q0060 1248 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 GLO2YDR272W 825 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 EFM4YIL064W 774 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MND2YIR025W 1107 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 PSR1YLL010C 1284 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 NEJ1YLR265C 1029 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MKC7YDR144C 1791 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 HPF1YOL155C 2904 nt5.64□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 VAN1YML115C 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 IPI3YNL182C 1668 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RAD53YPL153C 2466 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RHB1YCR027C 630 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 DIN7YDR263C 1293 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 DUO1YGL061C 744 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YGL101WYGL101W 648 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 CDC43YGL155W 1131 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YLF2YHL014C 1218 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 TFS1YLR178C 660 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 PCL1YNL289W 840 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 SSP2YOR242C 1116 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 CPA1YOR303W 1236 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 HSP104YLL026W 2727 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 SMF3YLR034C 1422 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MET7YOR241W 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RAT1YOR048C 3021 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YDR053WYDR053W 396 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 TRP4YDR354W 1143 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 KRE9YJL174W 831 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YKR104WYKR104W 921 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RBA50YDR527W 1320 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 VHS1YDR247W 1386 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 BRL1YHR036W 1416 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 TAX4YJL083W 1815 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YAP1801YHR161C 1914 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 SNT2YGL131C 4212 nt5.62□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YDR161WYDR161W 1164 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YFL034WYFL034W 3222 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 VAM7YGL212W 951 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 VMA16YHR026W 642 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YLR198CYLR198C 360 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RPC19YNL113W 429 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 STD1YOR047C 1335 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 PPR1YLR014C 2715 nt5.61□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RTT106YNL206C 1368 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MPS2YGL075C 1164 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 NQM1YGR043C 1002 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MRP13YGR084C 1020 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MRPS8YMR158W 468 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 MTF1YMR228W 1026 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 DAL82YNL314W 768 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 YNL319WYNL319W 441 nt5.6□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 PMA1YGL008C 2757 nt5.59□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 ADY2YCR010C 852 nt5.59□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 SKI8YGL213C 1194 nt5.59□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 RUF21RUF21 707 nt5.59□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 HRT1YOL133W 366 nt5.59□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 BAG7YOR134W 1230 nt5.59□□□□□ -1.51
UFO1Q04511 GIR2YDR152W 798 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 FSH1YHR049W 732 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 SYN8YAL014C 768 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 YKR073CYKR073C 321 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 YLR194CYLR194C 765 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 YNL108CYNL108C 813 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 SCP1YOR367W 603 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 GPI2YPL076W 843 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 YDC1YPL087W 954 nt5.58□□□□□ -1.52
UFO1Q04511 MKK2YPL140C 1521 nt5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms