Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHR1Q03591 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms