Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB2Q00653 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms