Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX1P78414 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX1P78414 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX1P78414 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX1P78414 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX1P78414 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX1P78414 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX1P78414 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX1P78414 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX1P78414 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX1P78414 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX1P78414 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX1P78414 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX1P78414 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX1P78414 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX1P78414 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms