Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOBP62745 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOBP62745 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOBP62745 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOBP62745 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOBP62745 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOBP62745 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOBP62745 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOBP62745 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOBP62745 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOBP62745 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOBP62745 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOBP62745 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms