Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1BP61266 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1BP61266 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1BP61266 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1BP61266 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX1BP61266 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1BP61266 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1BP61266 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1BP61266 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1BP61266 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1BP61266 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1BP61266 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1BP61266 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1BP61266 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1BP61266 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1BP61266 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1BP61266 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1BP61266 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1BP61266 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1BP61266 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1BP61266 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1BP61266 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1BP61266 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1BP61266 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1BP61266 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1BP61266 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1BP61266 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1BP61266 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1BP61266 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1BP61266 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1BP61266 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1BP61266 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1BP61266 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1BP61266 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1BP61266 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX1BP61266 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms