Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ROMO1P60602 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ROMO1P60602 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms