Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH12P55289 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH12P55289 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH12P55289 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH12P55289 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH12P55289 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH12P55289 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH12P55289 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH12P55289 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH12P55289 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH12P55289 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH12P55289 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH12P55289 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms