Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB1P54762 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms