Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP98P52948 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP98P52948 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP98P52948 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP98P52948 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP98P52948 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP98P52948 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP98P52948 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP98P52948 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP98P52948 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP98P52948 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP98P52948 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP98P52948 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP98P52948 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP98P52948 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP98P52948 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP98P52948 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP98P52948 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP98P52948 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP98P52948 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP98P52948 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP98P52948 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP98P52948 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP98P52948 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP98P52948 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP98P52948 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP98P52948 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms