Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RND2P52198 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RND2P52198 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RND2P52198 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RND2P52198 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RND2P52198 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RND2P52198 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RND2P52198 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RND2P52198 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RND2P52198 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RND2P52198 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RND2P52198 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RND2P52198 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RND2P52198 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RND2P52198 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RND2P52198 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RND2P52198 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms