Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK9P50750 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK9P50750 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK9P50750 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK9P50750 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK9P50750 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK9P50750 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK9P50750 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK9P50750 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK9P50750 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK9P50750 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK9P50750 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK9P50750 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms