Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT5P48643 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT5P48643 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT5P48643 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT5P48643 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT5P48643 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT5P48643 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT5P48643 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT5P48643 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT5P48643 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT5P48643 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT5P48643 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms