Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA4P48058 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms