Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms