Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP8P40818 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP8P40818 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP8P40818 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP8P40818 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP8P40818 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP8P40818 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP8P40818 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP8P40818 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP8P40818 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP8P40818 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP8P40818 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP8P40818 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP8P40818 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP8P40818 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP8P40818 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP8P40818 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP8P40818 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP8P40818 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP8P40818 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP8P40818 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms