Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms