Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IVDP26440 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IVDP26440 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IVDP26440 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IVDP26440 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IVDP26440 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IVDP26440 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IVDP26440 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IVDP26440 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IVDP26440 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IVDP26440 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IVDP26440 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IVDP26440 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IVDP26440 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IVDP26440 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IVDP26440 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IVDP26440 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IVDP26440 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IVDP26440 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IVDP26440 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IVDP26440 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IVDP26440 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IVDP26440 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IVDP26440 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IVDP26440 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms