Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP100P23497 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP100P23497 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP100P23497 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP100P23497 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP100P23497 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP100P23497 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP100P23497 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP100P23497 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP100P23497 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP100P23497 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP100P23497 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SP100P23497 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SP100P23497 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP100P23497 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP100P23497 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SP100P23497 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP100P23497 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP100P23497 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP100P23497 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SP100P23497 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SP100P23497 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SP100P23497 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP100P23497 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP100P23497 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP100P23497 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP100P23497 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP100P23497 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP100P23497 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP100P23497 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP100P23497 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP100P23497 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SP100P23497 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SP100P23497 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP100P23497 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP100P23497 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP100P23497 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP100P23497 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP100P23497 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP100P23497 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms