Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR3P22607 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR3P22607 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms