Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1D1P20393 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1D1P20393 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms