Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB6AP20340 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB6AP20340 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB6AP20340 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms