Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF3P15923 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF3P15923 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF3P15923 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF3P15923 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF3P15923 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF3P15923 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF3P15923 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF3P15923 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF3P15923 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF3P15923 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF3P15923 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF3P15923 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF3P15923 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF3P15923 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF3P15923 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF3P15923 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF3P15923 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF3P15923 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF3P15923 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF3P15923 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF3P15923 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF3P15923 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF3P15923 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF3P15923 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF3P15923 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF3P15923 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF3P15923 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF3P15923 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF3P15923 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF3P15923 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF3P15923 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF3P15923 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF3P15923 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF3P15923 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF3P15923 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF3P15923 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF3P15923 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF3P15923 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms