Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2RAP15509 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms