Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf88P0DMB2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf88P0DMB2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms