Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA8P0DM63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA8P0DM63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms