Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKCGP05129 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms